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课程简要介绍
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课程背景
代谢组学+肠道菌群+转录组+蛋白质组是继转录组+代谢组研究之后的又一热门研究方案。相比较于转录组+代谢组的研究,多组学的关联分析,将系统生物学中基因,蛋白,代谢和肠道菌群多个层面全关联,开启全多组学时代。
为了推动转录,蛋白,代谢和肠道菌群的多组学关联分析,一系列的基于相关性的,基于数据建模,基于KEGG的关联分析方法陆续被开发出来。基于转录组+蛋白质组+代谢组和肠道菌群的全组学的分析方案为,两两组学的关联分析,如转录组+蛋白质组,转录组+代谢组,蛋白质组+代谢组的关联分析和三组学的关联分析,转录组+蛋白质组+代谢组的关联分析。特举办全多组学 | 代谢组学+肠道菌群+转录组+蛋白质组生信分析学习会。
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主讲老师
董老师:医学专业博士研究生,擅长代谢组学生信分析、网络药理学+分子对接、转录组学数据分析、蛋白组学数据分析、肠道菌群课题设计+数据分析(基于云平台)、网络药理学联合代谢组学分析
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课程特色
1,所有课程均为腾讯会议,线上直播,学习方式更加灵活!
2,专人指导答疑贯穿全程:
3,全部课程资料,包括软件、脚本、课件、示例数据,统统提供!
4,课程基础进阶,零基础也可以轻松入门!
5,课程提供永久回放,不用担心错过课程,课后也可以反复观看!
课程详细设置
>>> 课程设置
时间安排
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主要内容
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涉及知识点(或举例)
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第一天
9:00-11:30
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代谢组学生信分析
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1代谢组学基本入门知识(课题设计、样品类型、所用的仪器设备、样品收集要求)
2,原始矩阵归一化处理,
3,Simca-p软件的使用
4,Pca、oplsda模型的建立、代谢物VIP值的计算
5,置换检验
6,差异代谢物的筛选、鉴定
7,HMDB、metaboanalyst数据库的使用,代谢通路富集分析
8,代谢物的pearson相关性分析
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第一天
2:00-5:00
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转录组学数据分析
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1,GEO数据库的使用和芯片下载,
2,R语言做差异分子的筛选
3,PPI蛋白互做网络构建
4,富集分析
5,基因的pearson相关性分析
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第二天
9:00-11:30
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蛋白组学数据分析
肠道菌群课题设计+数据分析(基于云平台)
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1,差异蛋白分子的筛选
2,PPI蛋白互做网络构建
3,富集分析
4,蛋白的pearson相关性分析
5,肠道进群入门知识,
6,课题设计
7,α、β多样性分析,
8,组间差异物种分析
9,Lefse分析,
10,功能分析
11,关联环境因子
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第二天
2:00-5:00
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多组学联合分析
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6,转录组+蛋白组/代谢组关联实验 设计、分析方法及应用
7,蛋白组+代谢组关联实验设计、 分析方法及应用
8,网络药理学和代谢组学的联合分析
9,R语言:相关性分析;在线工具:热图、火山图等常见图形的绘制
10,(转录组+蛋白关组联)
11,蛋白互作网络图、相关性调控网络图的应用介绍
12,Cytoscape软件及使用详解
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学习相关问题
会议时间 :
线上腾讯会议直播:
4月20-21日
主办单位:
玮瑜科研平台
承办单位:
上海玮瑜生物科技有限公司
上海玮瑜信息科技有限公司
会议费用:
3200/人
(可开会务、注册 技术服务 数据分析等发票)
联系方式:
徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)
员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)
报名回执:
【近期“数字化人才”培训课程:现场或线上,按需选择】
2024.04.16-18 新手段、新思路:单细胞及空间转录组生信分析实战培训班
2024.04.22-24 微生物组学数据分析与挖掘专题培训班
2024.04.25-28 计算机辅助药物设计与分子动力学模拟应用实践班
2024.05.06-09 人工智能技术在医药健康中的应用研讨班
2024.05.09-11 生命科学的数据可视化与科研作图——实用工具与技巧实战班
2024.05.10-11 人工智能--Python强化学习算法与应用案例实践培训班
2024.05.15-17 生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班
2024.05.17-19 孟德尔随机化培训班
2024.05.22-24 代谢组学数据分析培训班
2024.5.23-24 “测绘地理信息行业人工智能、大数据技术及其应用”培训班
2024.05.24-26 AIDD人工智能药物设计与发现培训
2024.05.29-31 基因组关联分析技术应用培训班2024.06.05-07 多组学数据分析及挖掘培训班2024.06.11-14 科研利器,尽在掌握:R语言数据分析与可视化高级研修班
2024.06.13-14 人工智能——Python自然语言处理快速入门与案例应用实践班
2024.06.18-21 生物医学公共数据深度挖掘及应用培训班
2024.06.19-21 关于举办网络安全渗透测试、防范技术与高级网络信息安全工程师培训班的通知
2024.06.27-28 知识图谱基础快速入门与案例应用实战班
2024.04.18-21·北京 关于举办《ChatGPT 科研应用、论文写作与项目开发》暨《人工智能(AI)应用工程师》专题培训班2024.05.09-12·深圳 关于举办《ChatGPT 科研应用、论文写作与项目开发》暨《人工智能(AI)应用工程师》专题培训班【视频课:随报随学】
【羽林学院】基因组关联分析技术应用培训班
【羽林学院】计算机辅助药物设计——分子模拟与蛋白互作研讨班
【羽林学院】生物分子互作软件实战班
【羽林学院】转录组专题实战班
【羽林学院】微生物组学数据分析与挖掘实战班
【羽林学院】生物信息学Python语言实战班
【羽林学院】数据分析与R语言制图实战班
【羽林学院】生命科学的数据可视化与科研作图——实用工具与技巧
【羽林学院】生物医学公共数据深度挖掘及应用培训班
【羽林学院】多组学数据分析及挖掘培训班
【羽林学院】10× Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班
【视频课:统计学系列】
【统计学系列】实用医学统计学系列培训班——基础统计学
【统计学系列】实用医学统计学系列培训班——高级统计学(核心篇)
【统计学系列】实用医学统计学系列培训班——高级统计学(提高篇)
敬请关注网站或微信公众号:生信会议
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